패널 데이터는 합동(pooled) 횡단면데이터와는 구별된다. 시계열데이터와 횡단면데이터를 합쳐 놓은 것이라는 점에서는 동일하나, 합동 횡단면데이터에서는 동일한 개체를 반복적으로 관찰하는 것이 아니라 서로 다른 개체가 매 시점에서 조사된다. 이에 반해 패널 데이터는 기본적으로 동일한 개체를 시간에 따라 반복적으로 서베이한다. 예를 들어 2000년~2006년까지 도시근로자 1,000명을 매년 조사할 때 동일한 1,000명을 매년 조사하면 패널 데이ㅌ이고, 매년 서로 다른 1,000명을 조사하면 합동 횡단면데이터이다.
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